En mayo de 2001 Ecologistas en Acción presentó ante el Defensor del Pueblo una denuncia contra el Gobierno español por el incumplimiento del ordenamiento jurí­dico español y de la normativa comunitaria por la aprobación del PHN. Dicha denuncia se basó fundamentalmente en el inicio de la tramitación parlamentaria, y posterior aprobación del Plan sin que se hubiese realizado una adecuada evaluación de sus repercusiones en los lugares de la Red Natura 2000, y sin el correspondiente proceso de información pública, tal y como establece la Directiva Hábitats.

Ante la denuncia, el Ministerio de Medio Ambiente respondió al Defensor del Pueblo en diciembre de 2001, argumentando que una primera evaluación habí­a sido realizada en el anejo del PHN "análisis ambientales", a la vez que consideraba discutible la necesidad de dicha evaluación. Ecologistas en Acción respondió en enero de 2002 demostrando que el tomo "análisis ambientales" no realiza la adecuada evaluación del impacto de las obras del PHN sobre la red Natura 2000 establecida por la normativa, y que la propia Comisaria Europea de Medio Ambiente habí­a reconocido la necesidad de que el Gobierno español realizase dicha evaluación.

Un año después, el Defensor del Pueblo se ha dirigido a Ecologistas en Acción reconociendo que las alegaciones realizadas por esta organización desvirtúan el informe del Ministerio de Medio Ambiente, lo que supone reconocer la necesidad de haber realizado antes de la aprobación del PHN una evaluación de su impacto sobre la red Natura. Además el Defensor del Pueblo ha solicitado al Ministerio un informe complementario en el que se aporte información suficiente sobre las cuestiones planteadas por la organización ecologista.

Ecologistas en Acción valora de forma muy positiva la decisión del Defensor del Pueblo, ya que supone reconocer que la tramitación parlamentaria del PHN fue ilegal, al incumplir uno de los requisitos establecidos en el ordenamiento jurí­dico español (Real Decreto 1997/1995) y en la normativa comunitaria (Directiva Hábitat 92/43/CEE), concretamente la necesidad de realizar una adecuada evaluación del impacto del PHN sobre la Red Natura 2000.

La red Natura 2000 es una red ecológica europea constituida al amparo de la Directiva Hábitats integrada por los Lugares de Interés Comunitario (LIC) y las Zonas de Especial protección para las Aves (ZEPA). Las obras incluidas en el PHN (grandes embalses, trasvases, encauzamientos, etc.) afectarán, al menos, a 86 ZEPA y 82 LIC de todo el Estado español.