Desde que empezaron las obras del tren de alta velocidad, las empresas que participan en su construcción han sufrido amenazas y actos de sabotaje por parte de ETA. Altuna y Urí­a, la empresa de la que es copropietario Ignacio Urí­a Mendizábal, sufrió actos de sabotaje en marzo de 2007. En agosto de 2008, ETA reivindicó la autorí­a de tres ataques con bombas a empresas que participaban en las obras de construcción (en Zarautz el 1 de junio, en Hernani el 9 de junio, y en Orio el 28 de julio) y reiteró sus amenazas contra ellos. Según fuentes policiales citadas en la prensa española, Ignacio Urí­a Mendizábal habí­a recibido diversas amenazas en los últimos años por negarse a realizar pagos a ETA.

Amnistí­a Internacional ha condenado sistemáticamente los graves abusos contra los derechos humanos cometidos por ETA y ha rechazado de forma categórica cualquier argumento u objetivo que pretenda justificar estos abusos.

Tras el asesinato el pasado 7 de marzo de 2008 del ex concejal del Partido Socialista, Isaí­as Carrasco, la organización instó una vez más a ETA a poner fin de inmediato y con carácter definitivo a su campaña de homicidios, amenazas y hostigamiento, entre otros abusos contra los derechos humanos. La organización ha hecho numerosos llamamientos a ETA para que ponga fin a su campaña de homicidios deliberados de civiles y para que respete los derechos humanos.